Berangkat dari YIA 07.54 - berangkat dari Wates 08.09 - tiba di Yogyakarta 08.33 WIB
Berangkat dari YIA 08.38 - berangkat dari Wates 08.53 - tiba di Yogyakarta 09.17 WIB
Berangkat dari YIA 10.25 - berangkat dari Wates 10.40 - tiba di Yogyakarta 11.04 WIB
Berangkat dari YIA 12.30 - berangkat dari Wates 12.45 - tiba di Yogyakarta 13.09 WIB
Berangkat dari YIA 13.28 - berangkat dari Wates 13.43 - tiba di Yogyakarta 14.07 WIB
Berangkat dari YIA 15.15 - berangkat dari Wates 15.30 - tiba di Yogyakarta 15.54 WIB
Berangkat dari YIA 16.05 - berangkat dari Wates 16.20 - tiba di Yogyakarta 16.44 WIB
Berangkat dari YIA 17.38 - berangkat dari Wates 17.53 - tiba di Yogyakarta 18.17 WIB
Berangkat dari YIA 18.10 - berangkat dari Wates 18.25 - tiba di Yogyakarta 18.49 WIB
Berangkat dari YIA 19.35 - berangkat dari Wates 19.50 - tiba di Yogyakarta 20.14 WIB
Berangkat dari YIA 20.06 - berangkat dari Wates 20.21 - tiba di Yogyakarta 20.45 WIB
Berangkat dari YIA 21.25 - berangkat dari Wates 21.40 - tiba di Yogyakarta 22.04 WIB
Jadwal Kereta Bandara YIA Xpress
Selain Kereta Bandara YIA reguler, ada juga Kereta Bandara YIA Xpress yang tidak berhenti di Stasiun Wates. Berikut jadwal Kereta Bandara YIA Xpress yang dibagi menjadi dua rute:
1. Jadwal Kereta Bandara YIA Xpress rute Yogyakarta-YIA